อวัยวะเพศหรือที่เรียกว่าอวัยวะสืบพันธุ์เป็นส่วนหนึ่งของสิ่งมีชีวิตที่เกี่ยวข้องกับการสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศอวัยวะเพศถือเป็นลักษณะทางเพศหลักของสิ่งมีชีวิตอวัยวะเพศมีหน้าที่ในการผลิตและขนส่งเซลล์สืบพันธุ์ รวมทั้งอำนวยความสะดวกในการปฏิสนธิและสนับสนุนพัฒนาการและการกำเนิดของลูกหลานอวัยวะเพศพบได้ในสัตว์และพืชหลายชนิด โดยมีลักษณะแตกต่างกันไปตามสายพันธุ์